Kết quả “resequencing” cho thấy tính đa dạng di truyền và kiến trúc di truyền của nguồn vật liệu giống sầu riêng
Kết quả “resequencing” cho thấy tính đa dạng di truyền và kiến trúc di truyền của nguồn vật liệu giống sầu riêng
Nguồn; Yiwang Zhong, Liying Feng, Huidong Deng, Xiaohao Ji, Jing Zhang, Yangyang Sun, Peifan Lin, Yang Qiao, Shenghua Xie, Haibo Wang, Lijun Guo, Xuejie Feng. 2025. Genomic resequencing reveals genetic diversity, population structure, and core collection of durian germplasm. Commun Biol.; 2025 Aug 23; 8(1):1273. doi: 10.1038/s42003-025-08715-3.
Sầu riêng Durio zibethinus Murr. là loài cây ăn quả nhiệt đới có tầm quan trọng toàn thế giới, được đánh giáo cao nhờ hương vị độc đáo và giá trị dinh dưỡng. Tuy nhiên, chỉ có một nền tảng di truyền hẹp trong cải tiến giống sầu riêng. Tác giả tiến hành kỹ thuật “whole-genome resequencing” của 114 mẫu giống sầu riêng đa dạng được thu thập ở Trung Quốc, xác định hơn 39 triệu SNPs chất lượng cao trong toàn hệ thống genome sầu riêng, biểu thị các thành phần vô cùng đa dạng trong hệ gen cây sầu riêng. Kết quả phân tích cấu trúc quần thể cho thấy có 3 chùm gen chủ lực, được hỗ trợ bằng phương pháp PCA, phân tích di truyền huyết thống và mô phỏng toán STRUCTURE. Kết quả “genome-wide scans” xác định được những “sweeps” để tuyển chọn gen ứng cử viên, và nhiều gen khác có tiềm năng trong khi sàng lọc. Từ 114 mẫu giống sầu riêng, người ta xác định được tập đoàn cơ bản (core collection) đặc trưng cho nguồn vật liệt giống sầu riêng đại diện phần lớn đa dạng di truyền của loài. Tập họp này bao gồm cả giống ưu việt và những cá thể khác biệt nhau về di truyền. Kết quả cho thấy luận điểm khoa học về tính đa dạng di truyền và kiến trúc quần thể giống sầu riêng đang trồng trọt. Bộ sưu tập cốt lõi được xác định (core collection) và bản thể những biến thể di truyền được xây dựng là nguồn vật liệu quý giá phục vụ cải tiến giộng sầu riêng cũng như bảo tồn quỹ gen. Kết quả sẽ làm cho việc xác định được những alen ưu việt quy định các tính trạng nông học quan trọng và dẫn dắt những chương trình cải tiến giống cho tương lai.
Comments
Post a Comment