Babaco Mosaic Virus (BabMV) kích hoạt sự tái lập trình hệ transcriptome quy mô lớn của cây đu đủ Carica papaya
Babaco Mosaic Virus (BabMV) kích hoạt sự tái lập trình hệ transcriptome quy mô lớn của cây đu đủ Carica papaya
Nguồn: Maria Gabriela Maridueña-Zavala, Hamada AbdElgawad, Mohammad K Okla, Juan Manuel Cevallos, Gerrit T S Beemster, Carlos Noceda. 2025. Babaco Mosaic Virus (BabMV) Induces Genome-Wide Transcriptomic Reprogramming in Carica papaya. Physiol Plant; 2025 May-Jun; 177(3):e70270. doi: 10.1111/ppl.70270.
Hình: Triệu chứng của bệnh siêu vi trên cây đu đủ: Papaya BabMV và PRSV
Sự xuất hiện gần đây của bệnh siêu vi Babacco Mosaic Virus (BabMV), một potexvirus được biết xâm nhiễm Vasconcellea heilbornii (babaco), đã và đang làm dấy lên những lo ngại siêu vi như vậy xâm nhiễm trên giống đu đủ trồng. Muốn đánh giá tác động của BabMV trên cây đu đủ, người ta thực hiện một phân tích toàn diện transcriptome trên toàn hệ gen nhằm đánh giá ảnh hưởng của virus trên biểu hiện gen và phản ứng tự vệ của đu đủ (Carica papaya). Lá cây đu đủ 3-4 tháng tuổi được xét nghiệm ở 2, 10, 15, và 30 sau khi chủng bệnh (dpi) với nguốn vật liệu BabMV và so sánh với đối chứng. Ở cây giả và cây bị nhiễm virus sau khi chủng 2 và 10 ngày, có hơn 90% đoạn phân tử được giải trình tự RNAseq chúng được lập bản đồ di truyền với hệ gen đu đủ. Trái lại, ở 15 và 30 ngày sau khi chủng bệnh, chỏ có 31% được mapped trên genome đu đủ từ nguồn lá đu đủ nhiễm BabMV, trong khi, còn lại 69% chuỗi trình tự “reads” so sánh với hệ gen tham chiếu đối với virus genome, chứng minh rằng tải lượng virus rất cao. Nhìn chung, có 1585 gen đu đủ biểu hiện chức năng khác biệt nhau (differentially expressed) giữa lá đối chứng (mock: giả) và lá có bệnh BabMV được chủng vào. Ở 2-10 ngày sau khi chủng, những phản ứng sớm bao gồm sự gia tăng biểu hiện của gen liên quan đến biến dưỡng đường và cải biên thành tế bào, đó là sinh tổng hợp lignin. Ở 30 ngày sau khi chủng, những phản ứng muộn bao gồm các gen liên quan đến ROS (reactive oxygen species) và antioxidants, thông qua hoạt tính của hệ men cytochrome P450 enzyme. Điều này giải thích được điều tiết kiểu “up” của Mitogen-Activated Protein Kinases (MAPK3,18) và những yếu tố phiên mã TFs bao gồm protein WRKY40,60,70 và Ethylene Response Factor 1 (ERF1), được biết kích thích biểu hiện các gen đích mã hóa protein PR1 (pathogenesis-related proteins) và tăng cường cơ chế tự vệ của cây. Kết quả nghiên cứu làm tăng sự hiểu biết về tiến trình nhiễm BabMV, cho phép người ta phát triển chiến lược nghiên cứu hiệu quả hơn về kiểm soát bệnh siêu vi trên đu đủ.
Comments
Post a Comment