Hệ gen “haplotype” được tổng hợp trong giống sầu riêng KanYao (Durio zibethinus)

 Hệ gen “haplotype” được tổng hợp trong giống sầu riêng KanYao (Durio zibethinus)

Nguồn: Xiaohao Ji, Yiwang Zhong, Daojun Zheng, Shenghua Xie, Meng Shi, Xiaodi Wang, Fengzhi Liu, Xuejie Feng, Haibo Wang. 2025. Chromosome-scale haploid genome assembly of Durio zibethinus KanYao. Sci Data.; 2025 Mar 5; 12(1):384. doi: 10.1038/s41597-025-04656-y.

Sầu riêng (Durio zibethinus) là loài cây trồng nhiệt đới có giá trị về dinh dưỡng và thương mại. Theo nghiên cứu này, người ta tiến hành tạo ra hai hệ gen ở mức độ nhiễm sắc thể chất lượng cao, có tính chất haplotype, được giải mã của giống sầu riêng 'Kan Yao', 28 nhiễm sắc thể. Độ lớn phân tử của genome là 737.2 Mb và 763.8 Mb, với giá trị contig N50 là 22.9 Mb và 21.5 Mb, giá trị khung mang gen N50 là 25.9 Mb và 26.7 Mb, theo thứ tự. Mười chín nhiễm sắc thể được lắp ráp mà không có khoảng hở nào, chín nhiễm sắc thể còn lại có 1 đến 10 đoạn hở. “Genome annotation” (chú thích di truyền trên hệ gen) xác định được 53,125 và 53,101 gen có chức năng,cũng như xác định được 5,254 và 5,496 phân tử RNAs không có mã di truyền (non-coding). Hệ gen lắp ráp chất lượng cao này sẽ giúp cho hoạt động cải tiến giống quy mô phân tử được tốt hơn trong cải tiến giống sấu riên tương lai.

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40044694/

Hình: Sơ đồ kiến trúc nhiễm sắc thể sầu riêng. Hệ gen haplotype 1 (trên) và haplotype 2 (dưới)

Hình tam giác đỏ là telomers. Đường thẳng màu tím là đoạn hở